今井荣作是日本广岛原爆生还者，一向没有告知两个女儿这事。大女儿芳子在暑假兼职做导游时认识了香港作家李克强，并赞助他汇集原爆生还者及其第二代的资料。芳子男友木村真宗父母向今井提亲，今井不能不率直说出芳子是原爆第二代，但…

片名中的“东京战争”指的是，1969年秋，学生们为了阻止首相访美而进行的剧烈奋斗。影片的主人公少年元木，认为自己的一个友人在奋斗中因绝望而自杀。但同伙们并不这样认为。元木和女友把认为是自杀友人生前拍摄的影片放映在银幕上，但他…